冬月、警察より呼び出され六分儀ゲンドウ(32)と出会う。（ゲンドウの名前は知っていたが面識なし）

後日冬月はユイがゲンドウと付き合っていると聞く。
冬月のことをゲンドウに紹介したのはユイ。

冬月はその後、ゲンドウの目的がユイの才能とバックボーンである「ゼーレ」という組織であると聞く。

セカンドインパクト発生。

地下の巨人（アダム）に対しての何らかの実験中の事故と思われる。
唯一の生存者が調査隊隊長の娘、葛城ミサト(14)。

カヲルの誕生日ともされている。

愛知県豊橋市でもぐりの医者をしていた冬月のところに、南極調査隊への参加要請が来る。

国連による正式な南極調査隊派遣。参加者として冬月のほかにゲンドウもいた。
失語症の葛城ミサト（16）も同乗している。

冬月、ゲンドウがユイと結婚し碇姓になっていること、二人の間に子供がいることを知る。
調査で冬月は光の巨人の存在を知るが、他にも謎が多く簡単に答えは出なかった。

その後国連は、大質量いん石の落下が原因と公式発表。
ゼーレによる事実の隠蔽を感じた冬月は独自に調査を進める。

冬月は国連直轄の人工進化研究所を訪ね、所長であるゲンドウに対しゼーレのことを公表すると糾弾。
しかしゲンドウは冬月に地下施設（後のネルフ本部）や建造中のエヴァンゲリオン零号機を見せた上で仲間になるように誘いをかける。
同施設では赤木ナオコが生体コンピュータ（ＭＡＧＩ）の基礎理論を模索中。娘のリツコ（18）も出入りしている。またユイも研究所に所属している。
この段階ではアダム再生計画（Ｅ計画）が進行中。零号機はその雛形。

人工進化研究所（ゲヒルン）に入った冬月。
ゲヒルン、ゼーレはサードインパクトを起こさない為の組織と言うユイに、自分はゼーレではなくユイに賛同しているのだと告げる。
ユイは「シンジの為に」と口にする。この時シンジ２才。

その１週間後、ゲンドウの提唱により新たに人類補完計画に着手。
ユイ喪失を契機にゲンドウが変わったとはナオコの談。

赤木リツコ(20)、葛城ミサト(19)と第２東京大学にて出会う。
その後ミサトから加持リョウジ(20)を紹介される。

アスカ(4)の母キョウコ(31)死亡。アスカの回想が正しければ、アスカはエヴァのパイロットに選ばれている。

ＭＡＧＩの基礎理論完成。

リツコ(23)、ゲヒルンへ入局（大学卒業後すぐか）

発令所の躯体完成。
リツコはそこでナオコとゲンドウ(41)のキスを目撃。

ゲンドウ、綾波レイを引き取る。（逆算では９才のはずだが設定は５、６才。ユイ消失後に生まれたとすれば５、６才ではあるが・・・）
レイはすべての個人データが抹消されている。

ＭＡＧＩ完成。
ナオコ死亡（当時のレイがナオコにより絞殺されている）
翌日ゲヒルンの解体と同時に特務機関ネルフ誕生。

ミサトがゲヒルン第３支部（ドイツ）に入っていたことが判明、この時には日本に帰国している。